Dalam design system operasi linux semuanya diaggap direktori. Hard disks, partisi , flashdisk, cd-rom dan removable media adalah direktori. Root adalah sebuah direktori inti dalam system operasi linux, direktori-direktori lain berada dibawah root (/root)

/bin – aplikasi biner penting
/boot – berkas yang diperlukan untuk mem-boot komputer
/dev – berkas device
/etc – berkas konfigurasi, startup, dll
/home – direktori inti untuk pengguna
/lib – library sistem
/lost+found – menyediakan sistem lost+found untuk berkas yang ada dibawah direktori root
/media – mount removable media seperti CD-ROM, flashdisk, dll
/mnt – untuk me-mount sistem berkas
/opt – tempat lokasi untuk menginstal aplikasi tambahan
/proc – direktori dinamis khusus yang menangani informasi mengenai keadaan dari sistem, termasuk proses yang sedang berjalan
/root – direktori inti untuk root
/sbin – sistem biner penting
/sys – mengandung informasi mengenai system
/tmp – berkas sementara
/usr – tempat aplikasi dan berkas yang sering digunakan oleh pengguna
/var – berkas variabel seperti log dan database

Lihat Linux Directory User Guide